手电筒锂电池两头有纸的作用是为了防止短路和保护电池的安全性。在电池的一端通常会覆盖一层绝缘纸，这样可以防止电池与金属接触导致短路。另一端的纸则可以起到密封和保护作用，避免电池在运输或存放过程中受到损坏或污染。因此，手电筒锂电池两头有纸的设计是为了确保电池的正常使用和延长其寿命。