更换第三代社保卡后社保暂停扣费是因为需要重新与银行系统进行关联。

第三代社保卡采用新的技术，需要与银行的相关系统进行更新和关联，这个过程需要一定的时间。

而在这个过程中，为了避免可能的错误扣费等问题，社保局通常会暂停扣费。

但是需要注意的是，暂停扣费并不代表个人社保缴费责任免除，如未及时补缴，可能会影响到个人的社保权益。

除了关联银行系统，更换第三代社保卡还有其他的好处，比如能够提高社保卡的安全性，减少信息泄露的风险，并且增加一些新的功能等。

所以，更换第三代社保卡对于个人和社会都是有益的。