入职协议的公司没有盖章只让劳动者签字，这种情况下协议是否有效，取决于具体的法律规定和实际情况。下面我将从几个方面进行分析。

首先，我们需要明确一点，入职协议是劳动者与用人单位之间的一种合同关系。在大多数情况下，入职协议需要双方的签字或盖章才能生效。因此，如果公司没有在入职协议上盖章，而只让劳动者签字，那么从法律程序上看，这份协议可能并不完整。

然而，具体的法律效力还需要考虑当地的法律规定。在某些地区，如果劳动者已经实际开始工作，即使没有正式的入职协议，也可能被视为存在事实上的劳动关系。在这种情况下，即使入职协议没有公司盖章，劳动者仍然可以依据事实上的劳动关系维护自己的权益。

另外，如果公司在其他场合或文件中使用了劳动者的签名，例如工资单、考勤记录等，这可能被视为公司对劳动者签名的认可。在这种情况下，即使入职协议没有公司盖章，也可能被视为有效的合同。

但是，如果劳动者在签署入职协议时并未得到公司的明确授权或指示，或者存在欺诈、胁迫等不正当手段，那么劳动者可以主张入职协议无效。此外，如果入职协议的内容违反了当地的法律法规，也可能导致协议无效。

综上所述，入职协议的公司没有盖章只让劳动者签字是否有效，需要根据具体情况进行评估。劳动者在签署入职协议前应该仔细阅读协议内容，并确保自己充分了解其中的权利和义务。如果有任何疑问或不确定的地方，建议咨询专业律师或法律机构以获取更准确的法律建议。