根据深圳市政府《幼儿园收费管理暂行办法》的相关规定，幼儿园缴费采取按学期收取，每个学期按5个月计算，缴费时间在刚开学的一周之内，并且收费必须遵循幼儿家长自愿、据实结算的原则，不得营利。

因此，深圳公立幼儿园上三天是否要缴费，需要根据具体情况来判断。如果上三天后紧接着是周末或法定节假日，那么可能不需要缴纳学费。如果上三天后紧接着是正常上课时间，那么可能需要缴纳学费。

建议咨询当地幼儿园或相关教育部门，以获取更准确的信息。