在硕士论文中，EndNote是一种常用的文献管理软件，它可以帮助作者方便地引用参考文献。在使用EndNote时，需要注意文献引用格式应当符合学术规范，例如APA、MLA、Chicago等格式。

在EndNote中，引用时需要先选择特定风格并插入引用，然后将该文献的详细信息导入EndNote库中，方便后续引用。最后，将EndNote中的参考文献生成目录即可。正确使用EndNote可以使硕士论文得到更好的评价和学术认可。