电子商务师和新媒体运营师的主要区别在于他们的职业定义和工作内容。

电子商务师是指专门从事电子商务活动的专业人士。他们的主要职责可能包括但不限于：电子商务平台的建设与维护、网络营销、电子支付、物流配送等。他们的工作重心在于利用互联网和数字技术进行商务活动。

新媒体运营师，也称为全媒体运营师，是综合利用各种媒介技术和渠道，采用数据分析、创意策划等方式，从事对信息进行加工、匹配、分发、传播、反馈等工作的专业人士。他们的主要职责包括但不限于：运用网络技术和工具进行数据化分析，指导媒体运营和信息传播的匹配性；负责对文字、声音、影像、动画、网页等信息内容进行策划和加工；将信息载体向目标受众进行精准分发、传播和营销；采集相关数据，根据数据分析、监控情况，调整媒体分发的渠道、策略；建立全媒体传播矩阵，构建多维度立体化的信息出入口。

总的来说，电子商务师更专注于电子商务活动的各个方面，而新媒体运营师则更侧重于利用各类媒介技术进行信息的加工、传播和分析。