有两个，分别是厦门到漳州，和厦门到金门。

厦门港五通码头距金门水头码头仅９．７海里，是距离金门最近的大陆客运码头，从五通码头乘高速船到金门只需２５分钟，而２００１年开通的“厦金”航线第一条航道目前从厦门国际邮轮中心厦金客运码头出发，至金门水头码头需约１小时。