从综合发展指数来看，深圳东莞合并后与上海相比还有差距。

原因在于深圳东莞合并后的地理面积和人口规模相对较小，基础设施建设和产业发展相对滞后。

此外，东莞作为一个工业城市，产业结构单一，对经济的发展造成了一定的制约。

不过，随着“粤港澳大湾区”建设的不断推进，深圳东莞合并后的经济和社会发展前景也非常广阔。

未来深圳东莞合并后可以在科技创新、智能制造、金融服务等方面加大投入力度，进一步提升城市综合实力和产业竞争力，从而更加接近或超越上海。