是的，没有营运证的小货车会有停运损失。首先，没有营运证意味着该车辆无法合法运营，一旦被交通管理部门查处，可能会面临罚款、扣车等处罚措施，导致经济损失。其次，没有营运证也意味着无法获得保险公司的保险保障，一旦发生交通事故或货物损失，将无法获得赔偿，进一步增加了经济风险。此外，没有营运证还可能导致信誉受损，难以获得客户的信任和合作机会，进而影响业务发展。因此，没有营运证的小货车会面临停运损失。