数据收集：收集基因数据，包括基因序列、基因表达水平等。
数据预处理：对数据进行清洗和标准化，去除噪声和异常值。
基因注释：根据基因序列和表达水平等信息，对基因进行注释，包括基因名称、功能、位置等。
基因差异分析：比较不同样本或不同条件下的基因表达水平，找出差异表达的基因。
聚类分析：根据基因表达模式的相似性，将基因分为不同的群组。
路径分析：分析基因之间相互作用的关系，找出关键基因或信号通路。
在处理复旦大学基因图谱时，可以按照以上步骤进行处理。需要注意的是，基因图谱的处理需要使用专业的生物信息学软件和分析方法，例如BLAST、Gene Ontology、Pathway Analysis等。同时，对于基因数据的处理需要遵循科学原则和伦理规范，保护个人隐私和数据安全。