招生对象：三年制大专的招生对象是高中毕业生或三校生，而五年制大专的招生对象是初中毕业生。
学制：三年制大专的学制是三年，而五年制大专的学制是五年。
教学计划：五年制大专分为“3+2”制和“五年一贯制”两种。其中，“3+2”制指的是学生可以只读三年，三年毕业以后，如果不想再继续深造，学校发给中专毕业证书；而“五年一贯制”则是五年连贯教学，中间不需要参加任何考试13。三年制大专则是“三年一贯制”的教学模式。
学费：五年制大专的学费是分段收取，前三年按中师或中专学校学费标准执行，后两年按普通高校的对应专业学费标准执行。而三年制大专的学费则是按照大专的收费标准分年收取。
社会认知度：三年制大专文凭的含金量更高。
招生门槛：五年制大专的招生门槛相对较低。
教育模式：五年制大专要进行职业教育和技能性教育，而三年制大专则以实践为主的技能性教育。
就业机会：在就业时，有的用人单位更倾向于三年制大专。