根据目前的政策规定，在新医改中，核磁共振门诊可以报销。需要注意的是，报销金额及报销限制可能会因医院、城市、地区等因素而有所差别，具体以当地医保政策为准。建议患者在就医前咨询医疗机构或当地医保部门，了解相关政策。