特殊门诊的病种申请数量取决于具体的政策和地区。一般来说，特殊门诊可以申请多个病种，但具体的申请数量限制可能因地区和政策而异。在某些地区和政策下，申请者可以同时申请多个病种，但每个病种的申请条件和审核标准可能会有所不同。因此，如果您想申请特殊门诊，建议您先了解当地政策和审核标准，然后根据自身情况选择适合的病种进行申请。