防水楼顶排气孔不能封闭。排气孔是为了排出房屋内的水蒸气和有害气体等，保持室内空气的流通和新鲜。如若封闭排气孔，室内湿气、有害气体将难以排出，可能会导致室内环境不良，影响人们的身体健康，甚至引发火灾等安全隐患。

因此，为了保持室内空气新鲜，防水楼顶排气孔不应该封闭。