最大区别：缴费比例不同

城镇职工养老保险，在职职工缴费比例8%，灵活就业缴费比例20%，同样缴费基数4000元，一个只需要交320元，全部进入个人账户，另一个交800元，其中320元进入个人账户，剩下480元进入统筹账户;

城镇职工医疗保险;在职人员缴费比例2%，灵活就业缴费比例不同省市有不同，一般5.6%-11%，缴费基数4000元，在职人员月扣80元;灵活就业人员月扣4000乘9%=360元