腐乳曲粉颜色不同，主要原因是曲粉霉菌种类差异和发酵工艺不同导致的。曲粉霉菌包括白色曲霉菌、黑色曲霉菌、黄色曲霉菌等，不同种类的曲粉霉菌产生的腐乳曲粉颜色不同。

此外，曲粉发酵过程中，温度、湿度、pH值等条件也会影响曲粉的颜色。

一般来说，白色曲粉霉菌产生的曲粉颜色较白，黑色曲粉霉菌产生的曲粉颜色较黑，黄色曲粉霉菌产生的曲粉颜色较黄。