要将《彼女与彼女之恋》手机游戏存档需要在游戏过程中进入游戏设置，选择“存档”功能，之后会弹出存档界面，可以选择存档编号，输入存档标题，点击“确认”即可完成存档。

另外，在下一次游戏时，可以通过进入“读档”功能，选择对应的存档编号，输入密码并点击“确认”来读取相应的存档，恢复游戏进度。