根据当前的政策来说，低保户年交1000元社保不会被取消。低保是指由政府提供给生活困难的人们的一种基本社会保障制度，其目的是确保低收入人群的基本生活需求得到保障。

社保是为了强化个人和家庭的社会保障而设立的制度，包括养老保险、医疗保险、失业保险等。低保户支付1000元社保费用是属于其基本生活保障的范畴，并不会因此取消低保资格。然而，请注意政策可能会随时变化，最准确的信息应该咨询当地相关部门或具体政策文件。