定义不同

调取证据通知书是由公安机关出具，用于调查犯罪案件时，向第三方（指定人、单位或者银行）要求出具涉案相关证据材料的通知书，是对第三方证据调取进行法律确认的文书。

查询通知书是依据刑事诉讼法第十六章第二百六十一条之规定由公安机关出具，以查明案件事实的通知书，是要求相关机关、单位或者个人出具案件事实的材料的凭据文书。