农村特殊门诊可以通过医保报销，具体操作如下：

1.持有农村医疗保险卡在规定的定点医院就诊；

2.在就诊过程中，根据医生开具的诊断证明和处方药品，在医保电子结算系统中进行报销；

3.报销比例根据当地政策而定，一般为70%-90%不等。需要特别注意的是，农村特殊门诊报销范围有限，具体报销标准需根据当地政策和规定进行了解。