深圳市的社会医疗保险实行“两卡合一”制度，即将社保卡和市民卡合并为一张卡，名为深圳通。住院费用结算时，医院会将医保部分直接结算，而个人账户部分则需要本人自行支付。

具体扣个人账户的操作流程如下：

1. 在就医时，出示社保卡并告知医生需要使用医保账户支付部分费用。

2. 医院将医保部分费用直接结算，余额部分需要缴纳时，使用深圳通进行支付。缴费时，需要在POS机上刷卡，并输入卡号和密码，然后选择缴费金额进行支付即可。

3. 在支付完成后，查询深圳通余额时，医疗账户支付部分的金额已经被扣除，所剩余额为非医疗账户部分的金额。

需要注意的是，深圳通的余额是可以随时查询，并且可以随时进行充值。如果个人账户余额不足，需要在缴纳时先进行充值，才能够完成支付。