医师自行卖药存在着多种利润机制。首先，医师可能会从批发渠道购买药品，这些渠道的价格通常较低，这样医师就能够以较低的价格购进药品，并以略高于购进价格的价格出售给患者，从而获得利润。

此外，医师还可以利用自身的专业知识，在药品推荐和使用方面为患者提供指导和建议，并从中获得咨询费用或佣金。

除此之外，医师还可以通过与制药公司合作来销售药品，从中获得返利或奖励。不过，医师自行卖药的利润属于灰色地带，可能存在违法行为，应该加强监管和规范。