新东方英语宝典和自然拼读魔盒是两种不同类型的英语学习工具，主要差别在于教学理念和内容设置上。

新东方英语宝典是一套英语学习教材，旨在帮助英语学习者打好基础，学好英语，教材内容丰富，并注重听说读写能力的全面提升。

而自然拼读魔盒则注重单词发音，通过学习基本音标和拼读规则，让学生掌握拼读技能。

从教学理念和内容设置上看，新东方英语宝典注重培养学生的语感和语言运用能力，而自然拼读魔盒则注重教学方法的科学性和实效性，两者在英语学习中各有卓越之处，学习者应选择适合自己的学习方式。