在东莞，如果电动车闯红灯被电子眼抓拍，处理方式主要取决于电动车的类型。如果电动车属于机动车类型并已上牌，那么根据道路交通安全法的规定，会处以200元罚款并扣6分。而如果电动车属于非机动车类型，虽然不会被扣分，但仍需缴纳罚款，具体金额根据道路交通安全法的规定，可能是五元以上五十元以下。

无论是哪种类型的电动车，闯红灯都是违反交通规则的行为，不仅危及自身安全，也可能对他人造成危害。因此，骑行电动车时应严格遵守交通规则，确保自身和他人的安全。