农村自建房合同应该明确写出房屋的建设内容、质量标准、使用权及争议解决方式等条款，对双方的权利义务做出约定，签订后应经双方共同确认并保留好有效证据。同时，合同应符合法律法规及当地规定，确保合法合规。只有在以上方面都做到位，合同才能够获得生效。