一旦公安机关查扣到假币，通常会将假币送往相关的鉴定机构进行鉴定。如果鉴定结果确认为假币，公安机关将会根据相关法律法规对假币进行处理。

根据《中华人民共和国刑法》和《人民币管理条例》，生产、运输、买卖伪造的货币，或者有意将伪造的货币流入市场，构成犯罪，将被追究刑事责任。如果发现有人制造、买卖或者故意流通伪造货币，公安机关将对涉案人员进行立案调查，追究相应的刑事责任。

对于查扣到的假币，根据相关法律法规，公安机关可以将其予以没收，并通知中国人民银行处理。如果查扣到的假币涉及较大金额或涉及重大案件，公安机关还可能会将案件移交给相关部门进行进一步调查和处理。