北京单位社保开完户后，想要实现自动扣款，需要进行以下操作：

1. 与银行签订代扣代缴协议：单位需要与银行签订代扣代缴社保费用的协议，确认代扣代缴的时间、金额等具体信息。

2. 提交缴费单据：每月社保费用核算完毕后，单位需要向银行提交缴费单据，包括社保缴费基数、缴费金额等信息。

3. 确保银行账户有足够的余额：为确保自动扣款成功，单位需要确保银行账户中有足够的余额用于支付社保费用。

4. 核对缴费记录：自动扣款成功后，单位需要及时核对缴费记录，确保缴费金额准确无误。

5. 保存缴费凭证：缴费成功后，单位需要保存缴费凭证，以便日后查验。

以上就是北京单位社保开完户后，实现自动扣款的操作步骤。在操作过程中，如有疑问，可以咨询当地社保局或银行工作人员。