是的，本科论文交上去后仍然会被查。学校和教师通常会有一定的抽查机制，以确保学生的学术诚信和作品的原创性。此外，现在有很多反抄袭软件和网络工具可以轻松检测文本的相似度和抄袭程度。因此，学生应该遵循学术诚信原则，完整、准确、合法地引用来源，并保持原创性。